pyvista.examples.examples.load_frog_tissues

pyvista.examples.examples.load_frog_tissues#

load_frog_tissues()[ソース]#

Load frog tissues dataset.

このデータセットにはカエルデータセットの組織分割ラベルが含まれます.

Added in version 0.44.0.

戻り値:
pyvista.ImageData

データセット.

データをロードします

>>> import numpy as np
>>> import pyvista as pv
>>> from pyvista import examples
>>> data = examples.load_frog_tissues()

組織ラベルを体積としてプロットします

まず,プロットパラメータを定義します

>>> # Configure colors / color bar
>>> clim = data.get_data_range()  # Set color bar limits to match data
>>> cmap = 'glasbey'  # Use a categorical colormap
>>> categories = True  # Ensure n_colors matches number of labels
>>> opacity = 'foreground'  # Make foreground opaque, background transparent
>>> opacity_unit_distance = 1

プロットの解像度を画像の間隔の半分に設定します

>>> res = np.array(data.spacing) / 2

レンダリングパラメーターを定義します

>>> mapper = 'gpu'
>>> shade = True
>>> ambient = 0.3
>>> diffuse = 0.6
>>> specular = 0.5
>>> specular_power = 40

プロットを作成し,表示します

>>> p = pv.Plotter()
>>> _ = p.add_volume(
...     data,
...     clim=clim,
...     ambient=ambient,
...     shade=shade,
...     diffuse=diffuse,
...     specular=specular,
...     specular_power=specular_power,
...     mapper=mapper,
...     opacity=opacity,
...     opacity_unit_distance=opacity_unit_distance,
...     categories=categories,
...     cmap=cmap,
...     resolution=res,
... )
>>> p.camera_position = 'yx'  # Set camera to provide a dorsal view
>>> p.show()
../../../_images/pyvista-examples-examples-load_frog_tissues-1_00_00.png

参考

Frog Tissues Dataset

詳細はデータセットギャラリーのこのデータセットをご覧ください。

Frog Dataset

医学のデータセット

他の医療データセットをブラウズします。